Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Col1a2Q01149 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms