Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf2raQ00941 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms