Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms