Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp10Q000W5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms