Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb4P99026 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms