Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn1bP97952 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms