Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx2P97474 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms