Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms