Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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