Protein–RNA interactions for Protein: P70371

Terf1, Telomeric repeat-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Terf1P70371 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Terf1P70371 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Terf1P70371 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Terf1P70371 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Terf1P70371 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms