Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casp4P70343 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms