Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfi1P70338 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms