Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms