Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UbdP63072 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UbdP63072 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms