Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3P62908 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3P62908 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms