Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab1AP62821 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms