Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsnl1P62761 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms