Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl27P61358 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms