Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms