Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem258P61166 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem258P61166 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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