Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sem1P60897 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sem1P60897 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms