Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Csrnp3P59055 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms