Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms