Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckbrP56481 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms