Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh11P55288 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms