Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a1P55014 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc12a1P55014 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms