Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acod1P54987 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acod1P54987 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms