Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms