Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms