Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms