Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GdnfP48540 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms