Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx2P48031 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms