Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CratP47934 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CratP47934 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CratP47934 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CratP47934 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CratP47934 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CratP47934 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CratP47934 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CratP47934 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CratP47934 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CratP47934 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CratP47934 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CratP47934 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CratP47934 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CratP47934 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CratP47934 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CratP47934 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms