Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc19a1P41438 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms