Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms