Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TtlP38585 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtlP38585 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtlP38585 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtlP38585 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtlP38585 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms