Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TpoP35419 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TpoP35419 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TpoP35419 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TpoP35419 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TpoP35419 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TpoP35419 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TpoP35419 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TpoP35419 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TpoP35419 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TpoP35419 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TpoP35419 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms