Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp12P34960 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms