Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc1P34928 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc1P34928 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc1P34928 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc1P34928 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc1P34928 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc1P34928 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc1P34928 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc1P34928 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms