Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Saa4P31532 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Saa4P31532 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Saa4P31532 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms