Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx2P31316 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms