Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms