Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msr1P30204 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msr1P30204 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms