Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VtnP29788 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VtnP29788 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VtnP29788 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VtnP29788 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms