Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp1P29452 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms