Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms