Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxrgP28705 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxrgP28705 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxrgP28705 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms