Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb1P28230 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms