Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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