Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms